А задачи эти именно что разные: минимальную школьную программу должен усвоить практически любой ученик (кроме совсем уж асоциалов), и поэтому отметки в аттестате большого значения не имеют, тогда как его наличие - имеет.
Тогда как высшее образование просто по определению не является всеобщим (поскольку оно "высшее") и там задача - отобрать из желающих получить данное образование наиболее к тому пригодных. Что заведомо непросто - скорее всего для каждой отдельной специальности должны использоваться специальные тесты.
PS. То есть если бы нынешний ЕГЭ, какой он есть, использовался исключительно как школьный выпускной - это было бы дело однозначно положительное. А также поддающееся осмысленному улучшению при надобности.
Причем этого, кажется, никто и не отрицает.